对于试管婴儿和新生儿,试管婴儿双胎妊娠早产、试管婴儿宫内发育迟缓、宫内窘迫和试管婴儿出生缺陷的发生率明显高于单胎妊娠。试管婴儿双胎妊娠的晚期流产率和早产率远高于试管婴儿单胎妊娠,因此即使是健康的足月试管婴儿也无法成功分娩。即使试管婴儿存活,试管婴儿早产儿的器官和系统发育也可能落后于单胎试管婴儿。
除了体外受精的生理影响外,体外受精双胎妊娠分娩和早产儿的治疗和抚养也远远高于单胎妊娠的体外受精足月,这将给普通家庭带来巨大的压力。同样,体外受精医生建议37岁以下:体外受精单胚胎移植;37~39岁:获得试管婴儿胚胎的人,试管婴儿单胚胎移植;无试管婴儿胚胎者,考虑试管婴儿双胚胎移植。